Macユーザーのためのバイオインフォ講座
を目指した備忘録．
Mac OSX 10.7.5 (~2015.09)
Mac OSX 10.11.4 (2016.04~)
対象：「ターミナル開いたことあるよ」「cdとlsは使ったことあるよ」くらいの人
少しずつ充実させていきたいです．
目次
配列解析
ADMIXTURE
Bismark
Blat
Blast
bowtie2
clustal omega
ClonalFrameML
emboss
HyPhy
isPcr
in silico PCRのlocal版
Jellyfish
LiftOver
MAFFT
MaSuRCA
ms
PAML
PLINK
Prokka
pyRAD
RAxML
RSEM
SAMtools
SRA toolkit
T-Coffee
trimmomatic
trinity
VCFtools
その他
autoconf
automake
bc
homebrew
ssh-keygen
脚注
%
は，枠の中の% 以降をターミナルで入力orコピペ．
[~~]はあってもなくてもいい．