MAFFT

2012年12月26日　更新

MAFFTとは

幅広い方法を用意したマルチプルアラインメントツール．

1. MAFFTのサイトのDownload and InstallationのMax OS X から適したものをダウンロード．
普通はStandard packageで良いと思う．
2. ダウンロードしたmafft-7.015-signed.pkgをダブルクリック．
3. 以下指示通りに．

% mafft infile.fasta > outfile.fasta

　fasta形式で出力してくれる点が便利．
　稀にフリーズ?する．並列計算ならまだしも，直列で計算するときは注意が必要．