MaSuRCA

2018年2月23日　更新

MaSuRCAとは

全ゲノムアセンブリソフト．ショートリードとロングリードの両方を使えるアセンブラ．Nanoporeのシーケンサも対応．

インストール

1. MaSuRCAの最新版をここからDLしてダブルクリックなどで解凍．
2. インストール

で，bin/masurcaにパスを通せばどこからでも使えます．

使い方

1. アセンブリのための設定ファイルを作成します．
2. 作成した設定ファイルの中身を編集し，データのパスなどを指定します．
3. 設定ファイルから実行ファイルを作り，実行します．
ゲノムが大きい場合かなり時間がかかるので，スリープしないような設定になっているか確認すると良いと思います．

参考文献

http://www.genome.umd.edu/masurca.html