RSEM

2016年10月6日　更新

RSEMとは

RNA-Seq by Expectation-Maximizationの略．trinityのアウトプットから発現量を推定する際に用いた．
複数の解析方法のベンチマークの結果，他に比べてわずかに性能が良い．ただし時間がかかる．

github経由で導入，インストールします．

% git clone https://github.com/deweylab/RSEM
% cd RSEM
% make
% make install

RSEMディレクトリにパスを通せばどこからでも使えます．