RSEM
2016年10月6日 更新
RSEMとは
RNA-Seq by Expectation-Maximizationの略.trinityのアウトプットから発現量を推定する際に用いた.
複数の解析方法のベンチマークの結果,他に比べてわずかに性能が良い.ただし時間がかかる.
インストール
github経由で導入,インストールします.
% git clone https://github.com/deweylab/RSEM
% cd RSEM
% make
% make install
RSEMディレクトリにパスを通せばどこからでも使えます.
使い方
使用例
参考文献
githubのページ
本家のページ