Clustal Omega

2013年6月25日　更新

Clustal Omegaとは

Clustalファミリーの最新版．

1. clustal omegaのDLページのPrecompiled binariesから適したものをダウンロード．
MacユーザならStandalone Mac binary(PowerPC/64-bit Intel)(1.2.0)
2. ダウンロードしたディレクトリに移動して

% mv clustal-omega-1.2.0-macosx clustalo
% chmod u+x clustralo

それをパスの通っているディレクトリへ移す．

fasta形式のファイルをアラインメント，fasta形式で返す．

% clustalo -i input.fasta -o output.fasta

とりあえずつけられるオプション--auto.

% clustalo --auto -i input.fasta -o output.fasta